Penguin Massacre è uno sparatutto in terza persona, anzi, in terzo pinguino, in cui dovremo semplicemente massacrare tutti i pinguini che ci capiteranno a tiro. Meccanica di gioco molto semplice, ma condita dalla possibilità di acquistare nuove armi con i soldi guadagnati, per far fronte alle ondate di bersagli sempre più impegnative dei livelli successivi. Sono inoltre disponibili anche potenzialmenti per la resistenza agli attacchi, per la cura (healing) e la specializzazione di tiro.